凯尔霍提出了他的“变成作用”(transmutations)学说来代替上述观念。这一论点的看法是：早期岩体为一个缓慢而稳定的过程改造成为花岗岩和正长岩。凯尔霍将这一过程称之为“造花岗岩作用”(granitification)。他并声称找到过一个由沉积岩转变为花岗岩的实例；对于这一变化他既没重视与深部现象的联系也没考虑所涉及的温度升高。

在二十世纪三十年代，地质学家们就在哪些花岗岩是岩浆形成的，哪些是变质形成的或交代形成的这个问题上进行着激烈地争论。这一争端早在水戍论时代就已开始，直至十九世纪中叶，还纠缠于花岗岩是由水溶液中沉积形成的观念上。尽管自赫顿(Hutton)起，就已经认识到变质作用过程(莱伊尔提出的术语)，虽然对其性质还不够十分了解。甚至在使用显微镜以前，关于花岗岩是变质形成的问题就已经写了很多。赫顿本人则极力地提倡岩浆成因的观点。据赫顿意见，花岗岩不整合侵入层状岩石的特点、粗粒结晶组构和斜交岩层的花岗岩脉，都被认为是花岗岩由“地下熔浆(subterranean lava)”结晶形成的证据，地下熔浆后来称之为“岩浆”。

20世纪40年代(Gilluly，1948)以H．H．Read为代表的“变成论”者和以N．L．Bowen为代表的“岩浆论’’者之间的争论，随着其后越来越多的学者认同花岗岩的岩浆起源而结束。然而，组成花岗岩体的岩浆来自何方?用Bowen的话表示：Whence the granites?(花岗岩从何而来?)

花岗岩还可以根据暗色矿物种类进一步命名，如暗色矿物主要是黑云母，可称为黑云母花岗岩，这是常见的一种花岗岩。如为黑云母和白云母，其含量接近相等，可称为二云母花岗岩，如果暗色矿物以角闪石为主，则称为角闪花岗岩，如果暗色矿物以辉石为主，则称为辉石花岗岩，几乎不含暗色矿物的则可称为白岗岩。
初由H．H．Read在1933年提出的“有各种各样花岗岩”的名言，事实上，提出的花岗岩分类方案至少有20种(见Barbarin，1990、1999年的总结；以及Frost等人2001年对较常用的分类方法所作的评论)。普遍的分类方案是地球化学和/或称成因字母分类方案，例如将花岗岩分为S型、I型、M型、A
型和C型等(S型为由沉积岩改造而成的花岗岩；I型为岩浆起源；M型为地幔来源；A型为无水花岗岩；C代表紫苏花岗岩)；或者分为钙碱性、碱性、过碱性、过铝和铝质花岗岩等；或者根据构造背景分为“造山”花岗岩(大洋和大陆火山弧；大陆碰撞带)，“后造山”花岗岩(造山期后的隆起或塌陷区)，以及非“造山”花岗岩(大陆裂谷、热点、洋中脊、大洋岛)等。
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