成因不同
石灰岩是碳酸钙矿石(CALCITE)。海生物死了以后天然沉积胶结的叫碳酸盐岩石灰石。这种石灰石的外观有明显的沉积层次 ( 如蛇纹石) 。经过地壳运动后被覆盖在地下然后再因为地下岩浆爆发而被高温熔化成岩浆再喷发或者入侵到其他岩层之中的叫碳酸岩石灰石，通常可以看到里面有白色的条纹。
花岗石是一种由火山爆发的熔岩在受到相当的压力的熔融状态下隆起至地壳表层,岩浆不喷出地面,而在地底下慢慢冷却凝固后形成的构造岩,是一种深成酸性火成岩。属于岩浆岩(火成岩)，以石英、长石和云母为主要成分。
玄武岩是由火山喷发出的岩浆冷却后凝固而成的一种致密状或泡沫状结构的岩石。它在地质学的岩石分类中，属于岩浆岩(也叫火成岩)。

外观不同
石灰岩是古生物遗体沉积而成的化石。所以表面有生物屍骸形成的不同深浅的颜色。沉淀按不同年代而有色和花纹的差异与层次。原生的石灰石没有结晶。石板有抽象画似的云纹和色泽。又叫“云石”。
石灰石
花岗岩有明显的颗粒结晶。有明显的黑点(云母)，有无色半透明的石英和肉色的长石。它的石面是由前面三种结晶混合成的所以有密密麻麻的不同颜色的点。因此也叫“麻石”。
玄武岩是六角柱体直径不大于90公分。黑色。风化后变成深灰色。石的结晶很细。有的玄武岩有气洞。
硬度不同
石灰岩的硬度是2到3，质软，可以被花岗岩和石灰岩划刻。
花岗岩的硬度是8左右，可以在玄武岩和石灰石表面划刻出线。
玄武岩的硬度是4到5，不能划花岗岩。

特别是在华北及东北南部，因中奥陶世海侵达到，普遍沉积了层厚而质纯的石灰岩，为具有工业价值的水泥原料及治金工业原料。

石灰石的用量是所有矿石中比较大的，在炼铁、炼钢、冶金、制造玻璃、制造水泥熟料的过程中要有含碳酸钙85%以上的石灰石，用量是20到25%以上。同时它还是一种非常重要与常用的还原剂，有人说它是一切化工原料之母!
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